开展核酸检测实验室，要符合病原微生物实验室生物安全管理条例以及医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法等有关规定，具备经过卫生健康行政部门审核备案的生物安全二级及以上实验室条件，以及临床基因扩增检验实验室条件。独立设置的医学检验实验室，还应当符合医学检验实验室基本标准等要求。开展新冠病毒核酸检测的实验室应当设置以下区域：试剂储存和准备区、标本制备区、扩增和产物分析区。3个区域在物理空间上应当是互相独立的，不能有空气的直接相通。3个功能区域：1、试剂储存和准备区
贮存试剂的制备、试剂的分装和扩增反应混合液的制备，以及离心管、吸头等消耗品的贮存和准备。
2、标本制备区
转运桶的开启，标本的灭活，核酸提取及加入至扩增反应管等。
3、扩增和产物分析区
核酸扩增和产物分析，根据使用仪器的功能，区域可适当合并。如采用标本加样、核酸提取及扩增检测为一体的自动化分析仪，标本制备区、扩增和产物分析区可合并。
仪器设备
具备核酸检测能力的实验室，应当配备与开展检验项目相适宜的仪器设备，比如核酸提取仪、医用PCR扩增仪、生物安全柜、病毒灭活设备、保存试剂和标本的冰箱和冰柜、离心机、不间断电源或备用电源等相关仪器设备。
检测流程
接到新标本后，应当在生物安全柜内对标本进行清点核对。按照相关标准操作程序进行试剂准备、标本前处理、核酸提取、核酸扩增、结果分析及报告，实验室应当建立可疑标本和阳性标本复检的流程。
1、试剂准备
应当选择相关监督管理部门批准的试剂，并在选择标本采样管和核酸提取试剂时，使用试剂盒说明书上建议的配套标本采样管和提取试剂。核酸提取方法与标本保存液和灭活方式相关，有些核酸提取试剂，容易受到胍盐或保存液中特殊成分的影响，特别是一步法提取都需要使用试剂厂家配套的标本采样管。
2、标本前处理
已经使用含胍盐的灭活型标本采样管的实验室，这一环节无需进行灭活处理，直接进行核酸提取，而使用非灭活型标本采样管的实验室，则有孵育30分钟热灭活的处理方式。
3、核酸提取
将灭活后的标本取出，在生物安全柜内打开标本采集管加样。核酸提取完成后，立即将提取物进行封盖处理，并在生物安全柜内将提取核酸加至PCR扩增反应体系中。
4、核酸扩增
将扩增体系放入扩增仪，核对扩增程序是否与试剂说明书相符，启动扩增程序。扩增后反应管不要开盖，直接放于垃圾袋中，封好袋口，按一般医疗废物转移出实验室处理。
